Nein, in der Regel nicht.
Normalerweise können Modelle in Transportern nichts tun (Regelbuch S. 210). Dazu gibt es Ausnahmen bei manchen Fahrzeugen. Ich habe jetzt nur die Regeln der Drukhari vorliegen, da heißt es ausdrücklich, dass transportierte Einheiten in der Fernkampfphase schießen können. Das schließt also Abwehrfeuer aus. Ob es in anderen Codizes Fahrzeuge mit anderen Regeln gibt, weiß ich nicht. Ich nehme aber eher an, dass das überall in etwa gleich sein wird.