Ach der Imperator beschützt überhaupt nichts bevor sie nicht endlich diesen alten Stuhl abschalten. Danach kann er sich dann zu einer Warp Gottheit entwickeln und das Imperium hätte einen echten Gott.
Im Prinzip kann man das Prinzip "Gott" in W40k immer mit "Warpentität die ihre Energie selbst erhalten kann" gleichsetzen. Da die Chaosgötter ja scheinbar alle Eldar-Gottheiten getötet haben, Gork & Mork nur so vor sich hin existieren und der Imperator an den Thron gebunden ist, ist die Zahl der Götter doch arg zusammen geschrumpft.
Ich würde auch mal vermuten das die menschliche Idee "Gott" wenig mehr ist als Humbug. Bis kurz vor dem ersten Exodus haben sich die Chaosgötter ja nicht großartig um die Menschen gekümmert, wohl hauptsächlich weil halt der Imperator damals die Erde beschützt hat. Da Menschen aber für einen großteil der Macht der C-Götter verantwortlich sind (Slaanesh mal aussen vor), sind sie auch das ideale Werkzeug und der Imperator war ja so freundlich den Chaosgöttern die perfekten Krieger in die Hände zu spielen.
In der Zeit vor dem Exodus würde ich mal behaupten das die psionishe Energie die durch positive Anbetung der alten Götter entstand, irgendwo verpufft ist (oder beim Imperator gelandet ist), wärend all die negativen Psi-Wellen direkt beim entsprechenden Chaos gelandet sind. Die Kreuzzüge dürften für Khorne eine Zeit gewesen sein, an die er sich gerne zurück erinnert.
Die C'Tan sind übrigens alles andere als Götter. Sie werden zwar als Sternengötter bezeichnet sind aber "nur" eine sehr abgedrehte Lebensform, ohne Einfluss auf den Warp. Laut Necroncodex, war ein Problem der Necrontyr das sie im Gegensatz zu den Alten kaum Kenntnis in der Warpmanipulation hatten. Aber sie konnten wohl meisterlich Dimensionen manipulieren (fragt mich nicht).
Rein technisch gesehen dürften die Necrons auch die Feinde Numero Uno für die Chaosgötter sein (gleich neben den Tyras). Da beide Spezies alles Leben in der Galaxies auslöschen wollen. Das würde aber auch bedeuten das die Chaosgötter in ihrer Dimension festsitzen und nur noch mit ihren Dämonenspielen können (die paar die nicht verhungern). Das die Orks diese Apokalyspe vermutlich überstehen würden hilft auch nicht, da Orks ja nur Gork & Mork mit Energie versorgen.
Es wird übrigens irgendwo erwähnt das der Imperator persönlich den Drachen auf dem Mars einkerkern wollte, als dieser die Erde ernten wollte. Wie das mit dem 60 Millionen Jahre langen Schlaf der Necrons zusammen passt, fragen wir uns lieber nicht. Aber es wirft die Frage auf, ob der Imperator das geplant hatte, damit die Menschen auf dem Mars, die den Einflüsterungen des C'Tan erlegen sind, Maschinen für seinen Kreuzzug bauen. Das erklärt auch warum der Imperator als Ohmnissia angesehen wird. Der Drache dürfte ziemlich heftige Erinnerungen an den Imperator haben.
Außerdem klärt es die doch sehr große Ähnlichkeit zwischen den "Eisernen Menschen" (die den Weltenbrand ausgelöst haben) und den Necrons.
