Teil I: Der Werdegang des Imperators, die Primarchen, ihr Verlust und ihre Wiederentdeckung, der große Kreuzzug
Teil II: Der Große Kreuzzug (wie bei Empire Strikes Back viele parallele Handlungstsränge, viel Charakterzeichnung, die Beziehungen zwischen den Primarchen und der Primarchen zum Imperator werden näher beleuchtet, erste "Grüppchenbildungen" machen sich bemerkbar, Horus Aufnahme in den Kultistenzirkel wird zwar gezeigt, allerdings werden die Folgen nur angedeutet... )
Teil III: Heresy, beginnend mit Magnus Warnung und dem Angriff der Space Wolves auf Prospero, das Istvaan-Massaker wird der zentrale Handlungspunkt der ersten Hälfte, die Schlacht um Terra dauert dann eine gute Stunde, incl. der finalen Konfrontation auf Horus Schlachtkreuzer. Am Ende sieht man den Imperator im goldenen Thron, und es wird gesagt, daß, solange der Imperator lebt, Hoffnung für die Menscheit besteht...